据估计，在人类全部妊娠中，约75%以自然流产告终。其中，大部分胚胎在着床后很快就停止发育，仅表现为月经过多或月经延期，即早早孕流产。夫妻双方健康的情况下自然流产的发生率约为15%。发生在12周以前的流产定义为早期流产，妊娠12周至不足28周的流产定义为晚期流产。
更多自然流产是有原因的，如果在第一次发生后没有及时检查明确原因就再次怀孕，自然流产风险随产次、父母年龄增加而升高。
常见流产原因包括：
1.染色体异常
包括夫妻染色体异常和胚胎染色体异常。常见的夫妇染色体异常为平衡易位、罗伯逊易位等。复发性流产夫妇染色体异常的发生率为4%，而正常人群为0.2%，其中母源与父源之比为3:1。单次自然流产中胚胎染色体异常为主要原因，随流产次数的增加胚胎染色体异常发生率减少。
2.母体内分泌失调
黄体功能不全占23%～60%，高雄激素和高胰岛素血症降低了卵子质量和子宫内膜容受性，容易导致流产发生。甲状腺疾病甲状腺功能低下与反复发生的自然流产相关。糖尿病亚临床或控制满意的糖尿病不会导致流产。
3.母体生殖道的异常
包括单角子宫、双角子宫、双子宫及子宫纵隔等。其中尤以子宫不全纵隔最易导致流产及早产。主要由于纵隔部位内膜发育不良，对甾体激素不敏感，血液供应差。宫颈机能不全引起晚期流产和早产，是导致妊娠中期流产的主要原因。子宫肌瘤黏膜下肌瘤及大于5cm肌间肌瘤的与流产有关。
4.生殖道感染
细菌性阴道病患者妊娠晚期流产及早产发生率升高，沙眼衣原体、解脲支原体造成子宫内膜炎或宫颈管炎可致流产。
5.其他
不健康生活方式与流产相关。有学者报道，每天吸烟超过14支的女性，流产风险较对照组增加2倍。酗酒、过量饮用咖啡因以及环境因素如有机溶剂和毒物等的影响。
除了上述原因意外，夫妻检查中发现，自然流产两次以上的存在免疫抗体异常的表现；这种情况往往其他检查均正常，但怀孕后均在相同月份发生自然流产。
临床医生建议流产者休息2个月经周期或者3个月以上，是为了让子宫有较长的时间修复。一般来说自然流产后最好要等3-6个月以后再考虑要宝宝。
另外自然流产后决定要孩子之前最好夫妻双方一起到医院做优生优育的全面检查，看现在的身体情况是否适合怀孕。这样做的好处是可避免再次流产，减少妊娠并发症的发生，降低发病率。
自然流产后女性子宫、卵巢等生殖器官以及整个身体都有一个恢复的过程。另外自然流产后的妇女身体比较虚弱，需要一段时间才能恢复正常，如果怀孕过早往往因体力不足，营养欠佳而使胎儿发育不良而再次造成自然流产。因此在自然流产后，最好是在医生的指导下，再决定怀孕的时间。
